農家が共同で播種機を購入し、作業者を雇って播種を行い、その播種した育苗トレイを自分のハウスにて育苗していますが外部委託となるのでしょうか。

GAPではJGAP基準書の内容を満たした農場のルールを作り、そのルールに従って作業を行う必要があります。
そのルールに従って作業者が作業しているか農場の方が直接監督する場合は外部委託ではありません(農場のパート、アルバイトと同じ)。
農場の外部の方(委託先の責任者等)が監督する場合は外部委託となります。

お問い合わせの例において、労働者を雇っているのが認証農場であり、リーダーに作業のルールを指導・指示しているのが認証農場であれば外部委託には該当しません。
この場合、JGAPでは特にルールを文書化しておく必要はありませんが、審査において、作業者に対しどのようなルール・注意点があるか質問される場合があります。