生育途中から収穫まで果実袋(紙の袋)を柿にかぶせて栽培しています。その袋の安全性についてどのような項目の証明が必要でしょうか。

ご質問につきまして、食品衛生法規格・基準(昭和34年厚生省告示第370号)を利用してリスクで検討することになります。
紙については「食品用器具及び容器包装における再生紙の使用に関する指針」が出ています。下記URLをご覧ください。
https://www.mhlw.go.jp/file/06-Seisakujouhou-11130500-Shokuhinanzenbu/kami.pdf

この情報を果実袋メーカーに出し、農家が使用する際にどのように影響あるかの見解をいただくのがよろしいかと思います。